En Ruanda se han violado los derechos humanos a gran escala. La mayor violación es el genocidio ruandés de tutsis en 1994. El gobierno posterior al genocidio también es responsable de graves violaciones de los derechos humanos.
A medida que las ideas de descolonización se extendían por África, se crearon un partido tutsi y otro hutu. Ambos se militarizaron y, en 1959, los tutsis intentaron asesinar a Grégoire Kayibanda, líder del PARMEHUTU. Esto dio lugar al viento de destrucción conocido como la "Revolución Social" en Ruanda, violencia que enfrentó a hutus y tutsis, matando entre 20.000 y 100.000 tutsis y obligando a más a exiliarse.
Tras la retirada de Bélgica de África en 1962, Ruanda se separó de Ruanda-Urundi mediante referéndum, que también eliminó la monarquía tutsi, los mwami. En 1963, el gobierno hutu asesinó a 14.000 tutsis, después de que guerrillas tutsis atacaran Ruanda desde Burundi. El gobierno mantuvo los documentos de identidad étnicos obligatorios y limitó el número de tutsis en las universidades y la administración pública.
Durante el genocidio contra los tutsis en 1994, fueron masacrados unos 800.000 tutsis.[42]Los gobiernos posteriores, incluido el actual dirigido por el presidente Paul Kagame, han cometido graves violaciones de los derechos humanos.[43]El 22 de abril de 1995, el Ejército Patriótico Ruandés asesinó a más de 4.000 personas en la masacre de Kibeho.[44]En septiembre de 1996, Ruanda invadió Zaire, precipitando la primera guerra del Congo. Los objetivos inmediatos de la invasión fueron los grandes campos de refugiados hutus situados justo al otro lado de la frontera, en las proximidades de Goma y Bukavu, organizados bajo la dirección del antiguo régimen.[45] El ejército ruandés persiguió a los refugiados por todo Zaire, al tiempo que ayudaba a instalar al AFDL en el poder en Kinshasa. El historiador Gérard Prunier estimó el número de muertos entre los refugiados que huían entre 213.000 y 280.000.